Child Element Content Module (Template)

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(Teildokument von Pathologiebefund)
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Child Element Content Module

Ein Child Element ist ein Child Element eines CDA Headers oder einer CDA Section oder ein Element, das in verschiedenen Tiefen unterhalb eines <entry> Elementes verschachtelt wurde oder ein aus diesen Gegebenheiten kombiniertes Element.


Specimen Collector im Header

Template-Metadaten
Template-Typ Entry
Template ID 1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.1
generischeres Template
genutztes Templates keines
abgeleitete Templates keines
Generelle Beschreibung In diesem Template werden die Informationen zum Material gewinnenden Arzt, falls dieser nicht der Einsender ist, übermittelt.
allg. Erläuterung < Verweis auf eine allgemeine Erläuterungsseite >
Verhältnis zu IHE dt.Übersetzung
Ballotierungsstatus < Status der Verabschiedung >
Erweiterbarkeit geschlossen

Definition und Zweck

In diesem Template werden die Informationen zum Material gewinnenden Arzt, falls dieser nicht der Einsender ist, übermittelt.

Dieses Content Module kann nur im Header genutzt werden. Es darf nur verwendet werden, falls der Material gewinnende Arzt nicht der Einsender ist vgl. use cases).

Beispiel

  <participant typeCode="DIST">
    <time>
      <!-- date&time of specimen collection -->
      <high value="200911140805"/>
    </time>
    <associatedEntity classCode="CAREGIVER"> 
    <id root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.9.1" extension="801234567897"/>
    <addr nullFlavor="NASK"/>
    <telecom nullFlavor="NASK"/>
    <associatedPerson>
     <name> 
       <given>Roberta</given>
       <family>Slicer</family>
     </name>
    </associatedPerson>
   </associatedEntity> 
   </participant>

Spezifikation

tbd

Autor

siehe auch verkürzt in cdapath:Autor (author) (Template)

Template-Metadaten
Template-Typ Entry
Template ID 1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.2
generischeres Template
genutztes Templates keines
abgeleitete Templates keines
Generelle Beschreibung In diesem Template werden die Informationen zum Autor des Befundes / Befundberichts übermittelt.
allg. Erläuterung < Verweis auf eine allgemeine Erläuterungsseite >
Verhältnis zu IHE dt.Übersetzung
Ballotierungsstatus < Status der Verabschiedung >
Erweiterbarkeit geschlossen

Definition und Zweck

Dieses Content Module kann im CDA-Header, in <sections> und in verschiedener Tiefe eines <entry> genutzt werden. Es beschreibt den Autor, der zum ganzen Befundbericht oder zu Teilen desselben (Section, Observation, Gruppe von Observations) beigetragen hat. Ein Dokument oder ein bestimmter teil des Dokuments kann mehr als einen Autor haben. Ein Autor KANN eine Person oder ein Gerät (z.B. Messgerät, Auswertesoftware) sein. In beiden Fällen KANN die betreffende Organisation beschrieben werden.

Beispiel

  <author>
    <templateId root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.2"/>
    <time value="20090529094914.827+0100"/>
    <assignedAuthor>
      <id root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.9.1" extension="801234567897"/> 1875
      <telecom value="tel:+33-602030499"/>
         <assignedPerson>
           <name>
            <given>Karl</given>
            <family>Patholog</family> 1880
           </name>
         </assignedPerson>
         <representedOrganization>
           <id root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.9.2" extension="1120456789"/>
             <name>Institut für Pathologie Musterstadt</name> 1885
             <telecom nullFlavor="MSK"/>
             <addr nullFlavor="MSK"/>
         </representedOrganization>
     </assignedAuthor>
    </author>

Spezifikation

Dieses Content Modul enthält keine weiteren Content Module.

Datenelement Verw. Kard. Path and Constraints (Xpath + indentation) Vokabular / Quelle Bemerk. DT HL7 V2.5.1
Autor O [0..*] author OBR-35
Conformance R [1..1] templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.2"]
Autorisierungszeit R [1..1] time@value (1) ts
Identifizierung C [0..1] assignedAuthor
Identifier R [1..*] id II
Adresse R [1..*] addr AD
Telefon R [1..*] telecom TEL
Person C [0..1] assignedPerson (2)
Name R [1..*] name PN
Autorisierendes Gerät C [0..1] authoringDevice (2)
Typ R2 [0..1] code CE
Modellname R2 [0..1] manufacturerModelName SC
Softwarename R2 [0..1] softwareName SC
Organisation O [0..1] representedOrganization
Identifier R2 [0..*] id II
Name R [1..1] name ON
Telefon O [0..*] telecom TEL
Adresse O [0..*] addr AD


Bemerkungen:

(1) Die Autorisierungszeitist die Zeit, zu der der Autor zum Dokument beigetragen hat. Sie MUSS angegeben werden.

(2) Der Autor ist entweder eine Person oder ein autorisierendes Gerät.

Content Validator

tbd

Specimen Information Organizer


Template-Metadaten
Template-Typ Entry
Template ID 1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.4
generischeres Template
genutztes Templates keines
abgeleitete Templates keines
Generelle Beschreibung In diesem Template werden diejenigen Informationen organisiert, die zu verschiednen Acts an einem Material oder einer Gruppe von Materialien gehören
allg. Erläuterung < Verweis auf eine allgemeine Erläuterungsseite >
Verhältnis zu IHE dt.Übersetzung
Ballotierungsstatus < Status der Verabschiedung >
Erweiterbarkeit geschlossen

Definition und Zweck

Diese Content Modul wird nur innerhalb eines <entry> Elements verwendet.

Der Specimen Information Organizer ist ein einheitliches Entry, das durch die meisten Sections eines Pathologiebefundes genutzt wird. Es gruppiert diejenigen Informationen, die zu jeweils einem Act (Prozeduren und Observations)an einem Material oder einer Gruppe von Materialien in Beziehung stehen.

Beispiel

<entry>
   <organizer classCode="CLUSTER" moodCode="EVN">
    <templateId root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.4"/> 
       <!-- as many specimen collection procedures done -->
       <component>
         <procedure classCode="PROC" moodCode="EVN">
         <templateId root="1.3.6.1.4.1.19376.1.3.1.2"/> <!-- generic template --> 
         <templateId root=" "/> <!-- template of organ-specific procedure -->
         :                              <!-- See detail in specimen collection procedure -->
         </procedure>
       </component>

     <!-- as many batteries of problems observed -->
       <component>
        <organizer classCode="BATTERY">
          <templateId root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.8"/>
          <id> </id> <!-- mandatory problem identifier --> 
          <code> </code> <!-- mandatory type of problem -->
        </organizer>
    </component>
  </organizer>
</entry>

Spezifikation

In der Tabelle ist die genaue Struktur der Content Module mit Verwendung, Kardinalität, Path und Constraints der Datenelemente, Value Sets / Terminonologien aufgeführt.


Die verschachtelten Content Module sind diejenigen Elemente, die eine Child Template ID in der "Path & Constraints (Xpath+indentation)"-Spalte haben. Die Spalte "Vokabular & Quelle" pezifiziert dafür die verschachtelten Content Module. In der Spalte "N" werden zusätzliche Erläuterungen und Constraints aufgeführt.


Datenelement Verw. Card. Path and Constraints (Xpath + indentation) Vokabular
Quelle
N DT HL7v2.5.1
Specimen
Information
Organizer

organizer[@classCode="CLUSTER" and@moodCode="EVN"]

Conformance R [1..1] templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.4"]
Status R [1..1]

statusCode[@code="completed"]

CS OBR-25
Organizer time
(interval or point)
O [0..1]

effectiveTime

(3) IVL-TS OBR-7
OBR-8
Performing lab C [0..1] performer[@typeCode="PRF"]

/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.3.3.1.7"]

(8)
Laboratory
Performer
R [1..1]

templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.3.3.1.7"]

LAB TF-3:
2.3.3.22
OBX-23
OBX-24
OBX-25
Author C [0..*]

author /templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.2"]

PAT TF-3:
6.2.6.2
(4)
Informant O [0..*]

informant/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.6"]

PAT TF-3:
6.2.6.6
(5)
Transscriptionist O [0..*]

participant[@participationType="ENT"]/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.7"]

PAT TF-3:
6.2.6.7
OBR-35
Device O [0..*]

participant[@participationType="DEV"]/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.7"]

PAT TF-3:
6.2.6.7
OBX-18
Responsible O [0..*]

participant[@participationType="RESP"]/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.7"]

PAT TF-3:
6.2.6.7
OBX-25
Validator O [0..*]

participant[@participationType="AUTHEN"]/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.7"]

PAT TF-3:
6.2.6.7
OBR-33
Specimen
collection
procedure
R [1..*]

component/procedure[@classCode="PROC " and @moodCode="EVN"] /templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.3.1.2"]

PAT TF-3:
6.2.6.5
(1)
Problem
organizer
R2 [0..*]

component/organizer[@classCode="BATTERY" and @moodCode="EVN"] /templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.8"]

PAT TF-3:
6.2.6.8
(6)
Embedded Image O [0..*]

component/observationMedia
/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.10"]

PAT TF-3:
6.2.6.10
(7) OBX
Region of interest O [0..*]

component/regionOfInterest
[@classCode="ROIOVL" and moodCode="EVN"]

(7)
R [1..*]

id

Overlay shape R [1..*] code
Dimensions R [1..*] value
R [1..*]

entryRelationship[@typeCode="SUBJ"]

Embedded Image O [0..*]

component/observationMedia
/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.10"]

PAT TF-3:
6.2.6.10
OBX
General comment
on this specimen
O [0..*]

component/act[templateId/@root='1.3.6.1.4.1.19376.1.5.3.1.4.2’]
code[@code=’48767-8’
and @displayName=’Annotation Comment’
and @codeSystem=’2.16.840.1.113883.6.1’]
text/reference/@value
statusCode[@code=’completed’]

PCC TF-2:
6.3.4.6
(2)

Anmerkungen:
(1): Die Specimen collection procedure MUSS in allen Fällen vorhanden sein. Sie kann mehr oder weniger vollständig sein, abhängig von der dem Content creator zur Verfügung stehenden Information. In Fällen von gruppenweise untersuchten Specimen kann die Specimen collection procedure wiederholt werden, um die Charakteristik eines jeden einzelnen Specimen der Gruppe zu repäsentieren.

(2): Dieser allgemeine Kommentar erscheint im Specimen level der zugehörigen Section im Textblock.

(3): Zeitraum (Zeitpunkt), zu dem die Information erhalten und zusammengestellt wurde.

(4): Der Autor MUSS vorhanden sein, wenn er vom Hauptautor des befundes verschieden ist. Zum Beispiel könnte der Autor derjenige anfordernde Arzt sein, der die Klinische Information für den Pathologiebefund bereitgestellt hat.

(5): Der Informant ist derjenige Akteur (Person oder Organisation), der einiges zur Klinischen Information beigetragen hat, die durch diesen Organizer übermittelt wird.

(6): Observations an einem Specimen oder einer Gruppe von Specimen werden per Problem organisiert. Es MUSS ein Problem organizer pro beobachtetes Problem vorhanden sein.

(7): Der Organizer KANN ein Bild des Specimen beinhalten, entweder direkt eingebettet oder in einer ROI eingekapselt.

(8): Das ausführende Labor ist nur dann auf diesem Level vorhanden, wenn die Untersuchung dieses besonderen Specimen oder einer Gruppe von Specimen durch ein nachauftragnehmendes Labor durchgeführt wurde.

Generisches Specimen Collection Procedure Template

Template-Metadaten
Template-Typ Entry
Template ID 1.3.6.1.4.1.19376.1.3.1.2
generischeres Template
genutztes Templates keines
abgeleitete Templates keines
Generelle Beschreibung In diesem Template werden die maschinenlesbaren Daten zur Materialart und -gewinnung übermittelt.
allg. Erläuterung < Verweis auf eine allgemeine Erläuterungsseite >
Verhältnis zu IHE Gegenstand des IHE CP 2013-11-10, dt.Übersetzung, constraint bzgl. value sets und organspezifische templates
Ballotierungsstatus < Status der Verabschiedung >
Erweiterbarkeit geschlossen

Definition und Zweck

Das Specimen Collection Procedure <entry>Content Modul enthält in maschinenlesbarer Form die Informationen bezüglich eines Materials (Specimen) oder Gruppe von Materialien. Es ist nur innerhalb der Materialaufbereitungs- (Procedure steps) Section nutzbar.

Dieses Content Module strukturiert die maschinenlesbaren Daten, die die Charakteristiken der Materialien (Specimens) und die Prozedur ihrer Gewinnung charakterisieren: Typ des Materials, Typ der Materialgewinnungsprozedur, Zeitintervall, Durchführende (Person und Organisation), Quelle und Lokalisation des Materials [1]

Jedes Specimen Collection Procedure <entry>Content Modul wird durch drei (fünf?) Elemente beschrieben, die den in Klammern genannten SNOMED-CT Achsen angehören SOLLTEN:

- für das specimen/typeCode element (specimen), das aus einem Triplet von code, codeSystem und displayname besteht und die verschiedenen Specimen types kodiert,

- für das procedure/collectionMethodCode element (procedure), das aus einem Triplet von code, codeSystem und displayname besteht und die verschiedenen Specimen collection procedures kodiert,

- für das procedure/collectionSourceSiteCode element (body structure), dessen triplet die verschiedenen präzisen Lokalisationen beschreibt, aus denen das Material gewonnen wurde,

(- für das specimen/treatmentProcedureCode element (procedure), dessen triplet die verschiedenen präzisen Präparationsschritte beschreibt, die zum vorliegenden zu beobachtenden Specimen (z.B. gefärbter Schnitt) geführt haben,

- für das specimen/containerTypeCode element (physical object), dessen triplet die verschiedenen Containertypen beschreibt, in / auf denen das Specimen beobachtet wird).


Die Value sets KÖNNEN organspezifisch organisiert und z.B. durch PathLex repräsentiert werden.


(Each organ-specific APSR Document Content Module mandates an organ-specific template, child of the “Specimen Collection Procedure” generic template. This organ-specific child template has exactly the same structure as the generic one, and brings only a number of vocabulary constraints related to this specific organ:

• The value set bound to the procedure/code element, consisting in a list of triplets (code, codeSystem, displayName) representing the various specimen collection procedures that can be performed on this specific organ.

• The value set bound to the procedure/targetSiteCode element, consisting in a list of triplets (code, codeSystem, displayName) representing the various precise locations for collecting specimens from this specific organ.

Thus, a specimen collection procedure in an <entry> within an organ-specific APSR Document Content Module declares conformance to two templates: The “Specimen Collection Procedure” generic template and the “Specimen Collection Procedure” child template constraining the vocabularies for the contextual organ.)

Beispiel (HL7 - Specimen-FHIR v.0.80)

<Specimen xmlns="http://hl7.org/fhir"> 
 <!-- from Resource: extension, modifierExtension, language, text, and contained -->
 <identifier><!-- 0..* Identifier External Identifier --></identifier>
 <type><!-- 0..1 CodeableConcept Kind of material that forms the specimen --></type>
 <source>  <!-- 0..* Parent of specimen -->
  <relationship value="[code]"/><!-- 1..1 parent | child -->
  <target><!-- 0..* Resource(Specimen) The subject of the relationship --></target>
 </source>
 <subject><!-- 1..1 Resource(Patient|Group|Device|Substance) 
     Where the specimen came from. This may be the patient(s) or from the environment or  a device --></subject>
 <accessionIdentifier><!-- 0..1 Identifier Identifier assigned by the lab --></accessionIdentifier>
 <receivedTime value="[dateTime]"/><!-- 0..1 The time when specimen was received for processing -->
 <collection>  <!-- 1..1 Collection details -->
  <collector><!-- 0..1 Resource(Practitioner) Who collected the specimen --></collector>
  <comment value="[string]"/><!-- 0..* Collector comments -->
  <collected[x]><!-- 0..1 dateTime|Period Collection time --></collected[x]>
  <quantity><!-- 0..1 Quantity The quantity of specimen collected --></quantity>
  <method><!-- 0..1 CodeableConcept Technique used to perform collection --></method>
  <sourceSite><!-- 0..1 CodeableConcept Anatomical collection site --></sourceSite>
 </collection>
 <treatment>  <!-- 0..* Treatment and processing step details -->
  <description value="[string]"/><!-- 0..1 Textual description of procedure -->
  <procedure><!-- 0..1 CodeableConcept Indicates the treatment or processing step  applied to the specimen --></procedure>
  <additive><!-- 0..* Resource(Substance) Material used in the processing step --></additive>
 </treatment>
 <container>  <!-- 0..* Direct container of specimen (tube/slide, etc) -->
  <identifier><!-- 0..* Identifier Id for the container --></identifier>
  <description value="[string]"/><!-- 0..1 Textual description of the container -->
  <type><!-- 0..1 CodeableConcept Kind of container directly associated with specimen --></type>
  <capacity><!-- 0..1 Quantity Container volume or size --></capacity>
  <specimenQuantity><!-- 0..1 Quantity Quantity of specimen within container --></specimenQuantity>
  <additive><!-- 0..1 Resource(Substance) Additive associated with container --></additive>
 </container>
</Specimen>

Beispiel (IHE)

<!-- Specimen collection procedure -->
<procedure classCode="PROC" moodCode="EVN">
  <templateId root="1.3.6.1.4.1.19376.1.3.1.2"/>    <!-- generic template -->
  <!-- specimen collection act -->
   <code code="277261002" codeSystem="2.16.840.1.113883.6.96"
        displayName="Excision Biopsy"/>
  <!-- Specimen collection date& time -->
   <effectiveTime>            <!-- Specimen collection date& time -->
    <low value="201012150905"/>
    <high value="201012150935"/>
   </effectiveTime>
  <!-- Specimen source -->
   <targetSiteCode code="76752008" codeSystem="2.16.840.1.113883.6.96"
                  displayName="Breast"/>
  <!-- Specimen collector -->
   <performer>                
    <assignedEntity>
      <id root=" "/>
      <!-- ID of Organization collecting specimen -->
        <representedOrganization>
          <name> </name>     <!-- Name of Organization collecting specimen -->
        </representedOrganization>
    </assignedEntity>
  </performer>
  <participant typeCode="PRD">      <!-- this specimen collected under specimen collection procedure identifier-->
    <participantRole classCode="SPEC"> <!-- specimen id(s) -->
                  <id root=""1.3.6.1.4.1.19376.1.8.9.7" extension="01""/>
                  <playingEntity>
  <!-- Specimen type -->
   <code code="394911000" codeSystem="2.16.840.1.113883.6.96"
                           displayName="Wire guided wide local excision of breast lump under radiological control (procedure)">
                     </code>
                  </playingEntity>
    </participantRole>
  </participant> 
 </procedure>

Spezifikation

Das Material (Specimen Collection Procedure) Entry entspricht dem generischen Template von IHE LAB TF-3:2.3.5.5.

Es MUSS verwendet werden (R) mit wiederholbaren Kardinalitäten[0..*]) für jedes Specimen, für das Beobachtungen gemacht werden.

Dieses Content Modul enthält KEINE anderen Content Module

Die genaue Modulstruktur ist in folgender Tabelle dargelegt:

Datenelement Verw. Kard. Path and Constraints (Xpath + indentation) Vokabular / Quelle Bemerk. DT HL7 V2.5.1
Specimen collection procedure[@classCode=’PROC’ and

@moodCode=’EVN’]

Conformance to

generic template

R [1..1] templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.3.1.2"]
Conformance to

organ-specific template

R [1..1] templateId[@root] (V0)
Collection procedure R [1..*] code[@code and @displayName and

@codeSystem]

(V1) CD SPM-7
Specimen Collection procedure identifier R [1..*] Id II SPM-7
Collection time

(interval or point)

R2 [0..1] effectiveTime IVL_TS SPM-17
Approach site O [0..1] approachSiteCode[@code and @displayName and

@codeSystem]

CD SPM-10
Target site 2 [0..1] targetSiteCode[@code and @displayName and

@codeSystem]

(V2) CC SPM-8 &

SPM-9

Collector 2 [0..1] performer/assignedEntity OBR-10
Identifier R [1..*] id OBR-10.1
Adresse R2 [0..*] addr AD
Telefon R2 [0..*] telecom TEL
Name R2 [0..*] assignedPerson/name
Familienname R2 [0..*] family OBR-10.2
Vorname R2 [0..*] given OBR-10.3
Präfix R2 [0..*] prefix OBR-10.5
Suffix R2 [0..*] suffix OBR-10.4
Organisation R [1..1] representedOrganization
Id R2 [0..*] id II
Name R [1..1] name ON OBX-35
Typ O [0..1] standardIndustryClassCode (V3) CE
Produkt R [1..1] participant[@typeCode=’PRD’]
is a specimen R [1..1] participantRole[@classCode=’SPEC’]
Specimen ID R2 [0..*] id II SPM-2
Charakteristik R [1..1] playingEntity
Specimen Typ R [1..1] code[@code and @displayName and

@codeSystem]

(V4) CE SPM-4 &

SPM-5

Ankunft im Labor R2 [0..1] entryRelationship[@typeCode=’COMP’]
Act of reception R [1..1] entryRelationship[@typeCode=’COMP’]
Specimen im Labor

angenommen

R [1..1] code[@code="SPRECEIVE"

and @codeSystem="1.3.5.1.4.1.19376.1.5.3.2"

and @codeSystemName="IHEActCode"]

CD
Annahmezeit effectiveTime[@value] ts SPM-18

Bemerkungen zum Vokabular:

- (V0): Der spezifische Template identifier der organ-specifischen Specimen Collection Procedure wird in der Value Sets Appendix (siehe IHE-APSR Volume 4) angegeben.

- (V1): Für einen generischen Befundbericht (1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.1.1) ist der Value Set für den Specimen Collection Act nicht begrenzt. Constraint zu IHE: Die Prozedurenachse von SNOMED CT KANN verwendet werden. Constraint zu IHE: Für einen organ-spezifischen Befundbericht KANN der Value Set vorgegeben sein durch das organ-spezifische Specimen Collection Procedure Template (aufgelistet in Vol. 4).

- (V2): Für einen generischen Befundbericht (1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.1.1) ist der Value Set für den Specimen Collection Act nicht begrenzt. Constraint zu IHE: Die Body Structure Achse von SNOMED CT KANN verwendet werden. Constraint zu IHE: Für einen organ-spezifischen Befundbericht KANN der Value Set vorgegeben sein durch das organ-spezifische Specimen Collection Procedure Template (aufgelistet in Vol. 4).

- (V3): Der Value Set für den standardIndustryClassCode ist auf internationaler Ebene weder im Standard noch im Content Modul eingegrenzt. Dies kann durch nationale Erweiterungen basierend auf nationalen Klassifikationen geschehen.

- (V4): Für einen generischen Befundbericht (1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.1.1)oder einen generischen strukturierten AP Krebsbericht (1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.1.2) ist der Value Set für den Specimen Typ nicht begrenzt.


HL7-Terminology Bindings sind in folgender Tabelle aufgeführt:

Path Definition Type Reference
Specimen.type The type of the specimen CD [2]
Specimen.source.relationship Type indicating if this is a parent
or child relationship
Fixed [3]
Specimen.collection.method The technique that is used
to perform the procedure
CD [4]
Specimen.collection.sourceSite Codes describing anatomical locations.
May include laterality
CD [5]
Specimen.treatment.procedure Type indicating the technique used
to process the specimen
CD [6]
Specimen.container.type Type of specimen container CD [7]

Generische Beobachtungseinheiten (Observable entities) für die Specimen collection procedure sind in folgender Tabelle aufgelistet:

Datenelement CDA source data type Value set OID code displayName codeSystem codeSystemName
SpecimenType observation.code CD 66746-9 Specimen type 2.16.840.1.113883.6.1 LOINC
SpecimenSize observation.code CD Specimen size 2.16.840.1.113883.6.1 LOINC
SpecimenSizeLargestDimension observation.code PQ Largest Dimension 2.16.840.1.113883.6.1 LOINC
SpecimenSizeAdditionalDimension observation.code PQ Additional Dimension 2.16.840.1.113883.6.1 LOINC
SpecimenWeight observation.code PQ Specimen weight 2.16.840.1.113883.6.1 LOINC
SpecimenIntegrity observation.code CD Specimen integrity 2.16.840.1.113883.6.1 LOINC
SpecimenCollectionGuidance observation.code CD Specimen collection guidance 2.16.840.1.113883.6.1 LOINC
SpecimenCollectionTechnique observation.code CD Specimen collection technique 2.16.840.1.113883.6.1 LOINC
SpecimenSamplingSpecialStructures observation.code CD Specimen sampling of special structures 2.16.840.1.113883.6.1 LOINC
SpecimenTargetSite observation.code CD Specimen target site 2.16.840.1.113883.6.1 LOINC

Informant

tbd

Zusätzlicher Teilnehmer

tbd

Problem Organizer

Template-Metadaten
Template-Typ Entry
Template ID 1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.8
generischeres Template
genutztes Templates keines
abgeleitete Templates keines
Generelle Beschreibung In diesem Template werden die Informationen zu einer Batterie von pathohistologischen Beobachtungen (Observations) übermittelt.
allg. Erläuterung < Verweis auf eine allgemeine Erläuterungsseite >
Verhältnis zu IHE Gegenstand des IHE CP 2013-11-10, dt.Übersetzung
Ballotierungsstatus < Status der Verabschiedung >
Erweiterbarkeit geschlossen

Definition und Zweck

Diese Content Modul wird nur innerhalb eines Specimen Information Organizer <entry> Elements oder innerhalb der Materialaufbereitungs-Section verwendet.

Der Problem Organizer gruppiert eine Batterie von Observations, die zu einem einzelnen (spezifischen) Problem, wie zum Beispiel Entzündung, beniger, in-situ, oder invasiver Tumor, an einem Material oder einer Gruppe von Materialien durchgeführt wurden.

Problem Organizer Templates sollten für eine Reihe von Anwendungen entwickelt werden (OID 1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.8.x).

Beispiel

  <!-- The set of observations related to a single problem on a specimen -->
  <organizer classCode="BATTERY" moodCode="EVN">
   <templateId root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.8"/> 
   <id> </id> <!-- optional problem identifier -->
   <code> </code> <!-- optional type of problem -->
   <!-- participants -->
   <author> ... </author> 
   <informant> ... </informant>
   
   <!-- tumor staging observation (this specimen, this problem) -->
     <component>
      <observation> 
      </observation>
     </component>

    <!-- tumor grading observation (this specimen, this problem) -->
     <component>
      <observation>
      </observation>
     </component>

    <!-- ancillary tests observation results (this specimen, this problem) --> 
     <component>
      <observation>
      </observation>
     </component>
    </organizer>


Spezifikation

In der Tabelle ist die genaue Struktur der Content Module mit Verwendung, Kardinalität, Path und Constraints der Datenelemente, Value Sets / Terminonologien aufgeführt.

Die verschachtelten Content Module sind diejenigen Elemente, die eine Child Template ID in der "Path & Constraints (Xpath+indentation)"-Spalte haben. Die Spalte "Vokabular & Quelle" pezifiziert dafür die verschachtelten Content Module. In der Spalte "N" werden zusätzliche Erläuterungen und Constraints aufgeführt.

Datenelement Verw. Card. Path and Constraints (Xpath + indentation) Vokabular
Quelle
N DT HL7v2.5.1
Problem Organizer

organizer[@classCode="BATTERY" and@moodCode="EVN"]

Conformance R [1..1] templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.8"]
Problem type O [0..1] code (V1) CD OBR-4
Problem type
identifier
R [1..*] ID (V1a) II OBR-4
Status R [1..1]

statusCode[@code="completed", "aborted"]

(V2) CS OBR-25
Organizer time
(interval or point)
O [0..1]

effectiveTime

(1) IVL-TS OBR-7
OBR-8
Performing lab C [0..1] performer[@typeCode="PRF"]

/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.3.3.1.7"]

LAB TF-3:
2.3.3.22
(8) OBX-23
OBX-24
OBX-25
Author C [0..*]

author /templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.2"]

PAT TF-3:
6.2.6.2
(2) OBR-35
Informant O [0..*]

informant/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.6"]

PAT TF-3:
6.2.6.6
(3)
Transscriptionist O [0..*]

participant[@participationType="ENT"]/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.7"]

PAT TF-3:
6.2.6.7
OBR-35
Device O [0..*]

participant[@participationType="DEV"]/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.7"]

PAT TF-3:
6.2.6.7
OBX-18
Responsible O [0..*]

participant[@participationType="RESP"]/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.7"]

PAT TF-3:
6.2.6.7
OBX-25
Validator O [0..*]

participant[@participationType="AUTHEN"]/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.7"]

PAT TF-3:
6.2.6.7
OBR-33
Anatomic
pathology
observation
C [0..*]

component/observation
/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.9"]

PAT TF-3:
6.2.6.9
(4) OBX
Clinical
Laboratory
observation
C [0..*]

component/observation
/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.3.1.6"]

LAB TF-3:
2.3.5.11
(6) OBX
Embedded Image O [0..*]

component/observationMedia
/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.10"]

PAT TF-3:
6.2.6.10
(6) OBX
Region of interest O [0..*]

component/regionOfInterest
[@classCode="ROIOVL" and moodCode="EVN"]

(7)
R [1..*]

id

Overlay shape R [1..*] code
Dimensions R [1..*] value
R [1..*]

entryRelationship[@typeCode="SUBJ"]

Embedded Image O [0..*]

component/observationMedia
/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.10"]

PAT TF-3:
6.2.6.10
OBX
General comment
on this particular
problem observed on
this particular
specimen
O [0..*]

component/act[templateId/@root='1.3.6.1.4.1.19376.1.5.3.1.4.2’]
code[@code=’48767-8’
and @displayName=’Annotation Comment’
and @codeSystem=’2.16.840.1.113883.6.1’]
text/reference/@value
statusCode[@code=’completed’]

PCC TF-2:
6.3.4.6
(2)

Anmerkungen:

(1): Zeitspanne (eher Zeitpunkt), in der die Informationen zusammengestellt wurden.

(2): Der Autor MUSS vorhanden sein, wenn er vom Autor des Hauptbefundes abweicht.

(3): Der Informant ist ein Actor (Organisation oder Person), der klinische Informationen zum behandelten Problem beitrug.

(4): Es gibt so viele AP Observations, wie für die Untersuchung der Probe/des Problems benötigt werden.

(6): Es gibt so viele Laborbeobachtungen, wie für die Untersuchung der Probe/des Problems benötigt werden. Diese klinischen Laborbeobachtungen entsprechen dem Template, das in LAB TF-3:2.3.5.11 spezifiziert wurde.

(7): Dieser Organizer kann ein Bild beinhalten, entweder direkt eingebettet oder in einer ROI eingekapselt.

(8): Das durchführende Labor ist auf diesem Level nur vorhanden, wenn das spezifische Problem durch ein Unterauftragnehmndes Labor, das mit dem Pathologielabor nicht identisch ist, untersucht wurde.

Vokabular:

(V1): Der Problemtyp Code ist nicht begrenzt(?). Ein Value set muss entwickelt werden

(V1a): Der Problemtyp Identifier wird für jedes Problem, das durch Observations beschrieben werden soll, vergeben

(V2): Der Status Code ist "completed", wenn die gesamte Batterie von Untersuchungen durchgeführt wurde. Er ist "aborted", wenn einzelne Untersuchungsergebnisse nicht erhalten werden konnten.


Generische Probleme sind in folgender Tabelle aufgelistet:

Problem type LOINC SNOMED-CT
benignTumor 3898006
malignantInvasiveTumor 363346000
malignantNoninvasiveTumor 127569003
metastasis
inflammation
residualDisease 65320000
stage 258214002
grade 3847400007
diseaseClass 46019-6 64572001
diffuseFinding 19648000
focalFinding 87017008

Generisches Observation Template

Template-Metadaten
Template-Typ Entry
Template ID 1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.9
generischeres Template
genutztes Templates keines
abgeleitete Templates keines
Generelle Beschreibung In diesem Template werden diejenigen Informationen übermittelt, die zu einer pathohistologischen oder zytologischen Beobachtung (AP Observation) gehören.
allg. Erläuterung < Verweis auf eine allgemeine Erläuterungsseite >
Verhältnis zu IHE Gegenstand des IHE CP 2013-11-10, dt.Übersetzung
Ballotierungsstatus < Status der Verabschiedung >
Erweiterbarkeit geschlossen


alternativ cdaonk 1.2.276.0.76.3.1.131.1.10.3.1, cdaonk 1.2.276.0.76.3.1.131.1.10.3.2, cdaonk 1.2.276.0.76.3.1.131.1.10.3.8


Definition und Zweck

Dieses Content Modul kann nur in einem Entry genutzt werden.

Es kann für alle Arten pathohistologischer Beobachtungen, einschließlicher zusätzlicher Untersuchungsmethoden verwendet werden.

Dieses Generische Template beschreibt eine Läsion mittels einer Reihe allgemeiner Attribute.

OntoPathlex 2.0 1.jpg

Abb.: Ontologie von Läsionseigenschaften (Attributen) für eine AP Observation (Entwurf!!).


Jede spezifische pathohistologischer Beobachtung, z.B. an einem Tumor, ist an ein spezifisches Template, einem Child des Generischen Observation Template, gebunden. Dieses hat exakt die gleiche Struktur des generischen Template und bringt lediglich eine Reihe von Vokabularbegrenzungen hinsichtlich des Typs der Observation, der Organherkunft und des beobachteten Materials mit sich:

- den Code für die spezifische Observation, definiert als ein Value Set gebunden an das Observation/Code Element, enthält ein Triplet (code, codeSystem, displayName), der die spezifische Untersuchung repräsentiert,

- die Kardinalitäten und den Default Typ für das Observation/Value Element, das die Ergebnisse dieser Observation trägt,

- die Wertedomäne für diese Observation für den fall, dass diese Werte kodiert sind. Diese Domäne kodierter Werte ist als ein Value Set definiert, der an das Observation/Value Element gebunden ist und so viele Triplets (code, codeSystem, displayName)enthält wie es zugelassenene Werte für diese spezifische Observation gibt, die an einem Material oder einer Gruppe von Materialien eines spezifischen Organs vorgenommen wurde.


Eine pathohistologische Observation hat einen Status und eine effective time, kann verschiedene Teilnehmer (Personen, Geräte, Organisationen) beschreiben, kann eine Anzahl zusätzlicher Eigenschaften haben (Methode, Interpretation, Text) und kann eingebettete Bilder, Kommentare und Sub-Observations haben, die wiederum Observations sind.

Beispiele

GH: muss noch aktualisiert werden (2014-02-09)

- für einen histologischen Typ:

  <observation classCode="OBS" moodCode="EVN">
    <!-- Generic observation template -->
    <templateId root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.9"/>
    <code code="59847-4"
          codeSystem="2.16.840.1.113883.6.43.1"
          codeSystemName="LOINC"
          displayName="Histology and Behavior ICD-O-3"/> 
    <statusCode code="completed"/>
    <effectiveTime value="20100321063000.0000-0500"/>
    <value xsi:type="CD"
          code="8500/3"
          codeSystem="2.16.840.1.113883.6.43.1" 
          codeSystemName="ICD-O-3"
          displayName="Invasive carcinoma of the breast, no special type" />
    <!-- Reference to Specimen collection procedure -->
    <participant typeCode="SPC">
	<participantRole classCode="REFR">
		<id root="1.3.6.1.4.1.19376.1.3.1.2" extension="xx"/>
	</participantRole>
    </participant>
    <!-- Reference to Problem organizer -->
    <participant typeCode="IND"> 
        <participantRole classCode="REFR"> 
                <id root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.8" extension="yy"/> 
        </participantRole> 
     </participant>
    <performer> ... </performer>
    <author> ... </author>
    <informant> ... </informant> 
  </observation>

- für den Befund aus einer zusätzlichen Untersuchungsmethode:

  <observation classCode="OBS" moodCode="EVN">
   <!-- Generic observation template --> 
   <templateId root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.9"/>
   <code code="44640-1" 
         codeSystem="2.16.840.1.113883.6.1"
         codeSystemName="LOINC" 
         displayName="Estrogen receptor/​100 cells in Tissue by Immune stain"/>
   <statusCode code="completed"/>
   <effectiveTime value="20100321063000.0000-0500"/>
   <interpretationCode 
               code="16112-5" 
               codeSystem="2.16.840.1.113883.6.1"
               codeSystemName="LOINC"
               displayName="Estrogen receptor [interpretation] in Tissue"/>
   <methodCode code="117617002"
               displayName="Immunohistochemistry procedure"
               codeSystem="2.16.840.1.113883.6.96"
               codeSystemName="SNOMED-CT"/> 
    <!-- Reference to Specimen collection procedure -->
    <participant typeCode="SPC">
	<participantRole classCode="REFR">
		<id root="1.3.6.1.4.1.19376.1.3.1.2" extension="ww"/>
	</participantRole>
    </participant>
    <!-- Reference to Problem organizer -->
    <participant typeCode="IND"> 
        <participantRole classCode="REFR"> 
                <id root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.8" extension="zz"/> 
        </participantRole>
     </participant>
   <performer> ... </performer>
   <author> ... </author>
   <informant> ... </informant>
  </observation >

Spezifikation

In der Tabelle sind Content Module aufgelistet, die in der ersten Ebene verschachtelt werden können.

Name Typ Opt. Kard. Template ID Quelle
Autor h/e elt O [0..*] 1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.2 PAT TF-3: 6.2.6.2
Informant h/e elt O [0..*] 1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.6 PAT TF-3: 6.2.6.6
Zusätzl. Teilnehmer e elt O [0..*] 1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.7 PAT TF-3: 6.2.6.7
Kommentar e elt O [0..*] 1.3.6.1.4.1.19376.1.5.3.1.4.2 PCC TF-2: 6.3.4.6
Durchf. Labor h/e elt C [0..1] 1.3.6.1.4.1.19376.1.3.3.1.7 LAB TF-3: 2.3.3.22
Observation e elt O [0..*] 1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.9 PAT TF-3: 6.2.6.9
Eingeb. Bild e elt O [0..*] 1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.10 PAT TF-3: 6.2.6.10

In der folgenden Tabelle ist die genaue Struktur der zu verschachtelnden Content Module dargestellt:

Datenelement Verw. Kard. Path and Constraints (Xpath + indentation) Vokabular / Quelle Bemerk. DT HL7 V2.5.1
AP Observation observation[@classCode="OBS" and

@moodCode="EVN"]

OBX
Conformance to

AP observation generic template

R [1..1] templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.9"]
Conformance to

AP specific observation template

R [1..1] templateId[@root] (V0)
Reference to
Specimen
collection
procedure
identifier
R [1..1] @typeCode="REFR"
@extension=id
@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.3.1.2"
(V01) II
Reference to
Problem type
identifier
R [1..1] @typeCode="REFR"
@extension=id
@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.8"
(V02) II
Identifier R2 [0..*] id II
Code R [1..1] code (V1) CD OBX-3
Text O [0..1] text ED
Status R [1..1] statusCode[@code in {"completed", “aborted”}] (V3) CS OBX-11
Observation Time R [1..1] effectiveTime IVL_TS OBX-19
Wert R2 [0..*] value (V2) ANY OBX-2,

OBX-5, OBX-6

Interpretation R2 [0..1] interpretationCode CE OBX-8
Methode R2 [0..1] methodCode CE OBX-17
Durchf. Labor C [0..1] performer[@typeCode="PRF"]

/templateId [@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.3.3.1.7"]

LAB TF-3: 2.3.3.22 (1) OBX-23,

OBX-24, OBX-25

Autor C [0..1] author

/templateId [@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.2"]

PAT TF-3: 6.2.6.2 OBX-16
Informant O [0..1] informant

/templateId [@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.6"]

PAT TF-3: 6.2.6.6
Transscriptionist O [0..1] participant[@participationType="ENT"]

/templateId [@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.7"]

PAT TF-3: 6.2.6.7 OBX-35
Gerät O [0..1] participant[@participationType="DEV"]

/templateId [@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.7"]

PAT TF-3: 6.2.6.7 OBX-18
Verantwortlich O [0..1] participant[@participationType="RESP"]

/templateId [@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.7"]

PAT TF-3: 6.2.6.7 OBX-25
Validator O [0..*] participant[@participationType="AUTHEN"]

/templateId [@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.7"]

PAT TF-3: 6.2.6.7 OBR-33
Sub-Observation O [0..*] entryRelationship[@typeCode="COMP"] (3) OBX
AP Observation observation[@classCode="OBS" and

@moodCode="EVN"] /templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.9"]entryRelationship[@typeCode="COMP"]

PAT TF-3: 6.2.6.9
Conformance R [1..1]
eingebettetes Bild O [0..*] entryRelationship[@typeCode="COMP"] (2) OBX
R [1..1] observationMedia

/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.10"]

PAT TF-3: 6.2.6.10
Region of interest O [0..*] entryRelationship[@typeCode="COMP"] (2)
regionOfInterest[@classCode="ROIOVL"

and @moodCode="EVN"]

R [1..*] id
Overlay shape R [1..1] code
Dimensionen R [1..*] value
R [1..*] entryRelationship[@typeCode="SUBJ"]
eingebettetes Bild R [1..1] observationMedia

/templateId[@root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.10"]

PAT TF-3: 6.2.6.10 OBX
Kommentar zur Observation O [0..1] entryRelationship[@typeCode='SUBJ'

and @inversionInd='TRUE']

/act[templateId/@root='1.3.6.1.4.1.19376.1.5.3.1.4.2’]

code[@code=’48767-8’

and @displayName=’Annotation Comment’

and @codeSystem= ’2.16.840.1.113883.6.1’]

text/reference/@value

statusCode[@code=’completed’]

PCC TF-

Bemerkungen:

(1): Das durchführende Labor wird auf diesem Level nur aufgeführt, wenn diese Observation durch ein unterbeauftragtes Labor, verschieden von dem im Organizer, durchgeführt wird.

(2): Diese Observation kann ein illustrierendes Bild tragen, entweder direkt eingebettet oder verpackt in einer ROI.

(3): Das Ergebnis für eine Observation kann zu einer zusätzlichen Observation führen, um das Ergebnis zu verfeinern. Diese Sub-Observation ist wiederum eine AP Observation.


Bemerkungen zum Vokabular:

(V0): Der spezifische Template Identifikator der spezifischen AP Observation in Verbindung mit einem spezifischen Organ ist im Value Set (APSR Vol.4) niedergelegt Diese Regelung fällt mit Aktualisierung von APSR weg.

(V01): Der Identifikator für die Specimen collection procedure ist in der Materialaufbereitungs-Section hinterlegt.

(V02): Der Identifikator für das Problem ist in der Materialaufbereitungs-Section hinterlegt.

(V1): Der AP Observation Code wird dem Value Set entnommen, das durch das spezifische AP Observation Template mandatiert wurde (APSR Vol.4).Diese Regelung fällt mit Aktualisierung von APSR weg.

(V2): Die Default Werte für Datentyp, Kardinalität und Value Set für das <value> Element werden durch das spezifische AP Observation Template mandatiert (APSR Vol.4). Diese Regelung fällt mit Aktualisierung von APSR weg.

(V3): Der Observation statusCode ist "completed" wenn die Observation tatsächlich durchgeführt wurde und als Ergebnis zu einem Value Element führte. Ansonsten ist der Status der beabsichtigten Observation "aborted" und es wird kein Ergebnis folgen.

Eingebettetes Bild

tbd