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+ | Die Attribut-Wert-Paare werden textuell aus den codierten Informationen abgeleitet (derived). | ||
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+ | Hierzu gehören auch die Cancer Checklists. | ||
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+ | Die zu verwendenden Vokabularien sind im Anhang detailliert aufgelistet. | ||
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+ | Die Informationen werden als Attribut-Wert-Paare in Form einer Tabelle dargestellt, die wie folgt aussieht. | ||
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+ | {| class="hl7table" | ||
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+ | |Kalk histologisch||Ja | ||
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+ | Oder in XML: | ||
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+ | <tr> | ||
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+ | <td>Ja</td> | ||
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+ | <td>0,2</td> | ||
+ | </tr> | ||
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+ | ==Anlagen== | ||
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+ | Die Informationen zu immunhistochemischen Färbungen bestehen aus folgenden Informationen: | ||
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+ | |Antikörper (Kurzbezeichnung)||Code oder String??||2.16.840.1.113883.6.1 | ||
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+ | |Klon||String||1.2.276.0.76.5.???? | ||
+ | |- | ||
+ | |Hersteller||Code oder String??||1.2.276.0.76.5.???? | ||
+ | |- | ||
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+ | |- | ||
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+ | |- | ||
+ | |Gewebetyp||CD||1.2.276.0.76.5.???? | ||
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+ | |Färbeergebnis||CD||1.2.276.0.76.5.???? | ||
+ | |- | ||
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+ | |- | ||
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+ | |- | ||
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+ | |- | ||
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+ | |- | ||
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+ | Tabelle 4: Färbungen | ||
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+ | ======Text-Beispiel====== | ||
+ | Nachfolgend ein Beispiel in der Text-Darstellung: | ||
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+ | {{BeginPurpleBox|Beispiel}} | ||
+ | |||
+ | {| class="hl7table" | ||
+ | !Anti- körper!!Klon!!Her- steller!!AK- Klasse!!Proto- koll- ID!!Reak- tions-stärke!!Färbe- muster!!Vertei- lungs- muster!!%pos. Zellen!!Gewebe- typ!!Färbe- er- gebnis!!Fixie- rung!!Bild- analyse!!Score- Typ!!Score-Ergebnis | ||
+ | |- | ||
+ | |Ki67||30-9||Ventana||2||xyz||stark||nukleär||diffus||9||Tumor||positiv||FFPE||Immuno- Ratio|||| | ||
+ | |- | ||
+ | |Ki67||30-9||Ventana||2||xyz||keine||keine||keine||0||neg.Färbe- kontrolle||negativ||FFPE|||||| | ||
+ | |- | ||
+ | |CK5/6||D5/16B4||DAKO||1||uvw||mittel||membran- st. komplett||basal||||Tumor||positiv||FFPE|||||| | ||
+ | |- | ||
+ | |ER/PR pharmDX||1D5 / ER 2-123||DAKO||3||abc||stark||nukleär||diffus||87||Tumor||positiv||FFPE||Immuno- Ratio||Rem- mele||endokrin responsiv | ||
+ | |- | ||
+ | |ER/PR pharmDX||1D5 / ER 2-123||DAKO||3||abc||stark||nukleär||diffus||95||ext. Positiv<br>on-slide-kontrolle||positiv||FFPE||Immuno- Ratio|||| | ||
+ | |- | ||
+ | |ER/PR pharmDX||1D5 / ER 2-123||DAKO||3||abc||mittel||nukleär||fokal||30||int. Positiv<br>kontrolle||positiv||FFPE||Immuno- Ratio|||| | ||
+ | |- | ||
+ | |ER/PR pharmDX||1D5 / ER 2-123||DAKO||3||abc||keine||keine||keine||0||neg.Färbe<br>kontrolle||negativ||FFPE|||||| | ||
+ | |- | ||
+ | |ER/PR pharmDX||PgR 1294||DAKO||3||def||mittel||nukleär||diffus||38||Tumor||positiv||FFPE||Immuno- Ratio||Rem- mele||endokrin<br>responsiv | ||
+ | |- | ||
+ | |ER/PR pharmDX||PgR 1294||DAKO||3||def||keine||keine||keine||0||neg.Färbe<br>kontrolle||negativ||FFPE|||||| | ||
+ | |- | ||
+ | |} | ||
+ | |||
+ | {{EndPurpleBox}} | ||
+ | |||
+ | ======Abbildung in CDA====== | ||
+ | Kommentar: muss noch an Textbeispiel angepasst werden. | ||
+ | <syntaxhighlight lang="xml"> | ||
+ | <section> | ||
+ | <!-- Darstellung als Tabelle --> | ||
+ | <text> | ||
+ | <tbody> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>Antikörper</th> | ||
+ | <th>Klon</th> | ||
+ | <th>Hersteller</th> | ||
+ | <th>AK-Klasse</th> | ||
+ | <th>Protokoll-ID</th> | ||
+ | <th>Reaktionsstärke</th> | ||
+ | <th>Färbemuster</th> | ||
+ | <th>Verteilungsmuster</th> | ||
+ | <th>% pos. Zellen</th> | ||
+ | <th>Gewebetyp</th> | ||
+ | <th>Färbeergebnis</th> | ||
+ | <th>Fixierung</th> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td><content ID="d1">IF Ep MNF116</content></td> | ||
+ | <td><content ID="d2">positiv</content></td> | ||
+ | <td><content ID="d3">stark</content></td> | ||
+ | <td><content ID="d4"> </content></td> | ||
+ | <td><content ID="d5">diffus</content></td> | ||
+ | <td><content ID="d6">Formalin</content></td> | ||
+ | <td><content ID="d7">Tumor isolierte Tumorzelle</content></td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | ... | ||
+ | </tbody> | ||
+ | </text> | ||
+ | |||
+ | <!-— erste Information --> | ||
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+ | <observation classCode="OBS" moodCode="EVN"> | ||
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+ | <originalText><reference value="#d1"/></originalText> | ||
+ | </value> | ||
+ | </observation> | ||
+ | </entry> | ||
+ | |||
+ | <!-— zweite Information --> | ||
+ | <entry typeCode="DRIV"> | ||
+ | <observation> | ||
+ | <code code="????" | ||
+ | codeSystem="??????" | ||
+ | displayName="Antikörperfärbung Reaktion" /> | ||
+ | <value xsi:type="CD" code="2" codeSystem="????"> | ||
+ | <originalText><reference value="#d2"/></originalText> | ||
+ | </value> | ||
+ | </observation> | ||
+ | </entry> | ||
+ | |||
+ | <!-— dritte Information --> | ||
+ | <entry typeCode="DRIV"> | ||
+ | <observation classCode="OBS" moodCode="EVN"> | ||
+ | <code code="xxxx" | ||
+ | codeSystem="a.b.c.dx.y.z" | ||
+ | displayName="Antikörperfärbung Reaktionsstärke" /> | ||
+ | <value xsi:type="CD" code="3" codeSystem="????"> | ||
+ | <originalText><reference value="#d3"/></originalText> | ||
+ | </value> | ||
+ | </observation> | ||
+ | </entry> | ||
+ | |||
+ | <!-— vierte Information --> | ||
+ | <entry typeCode="DRIV"> | ||
+ | <observation classCode="OBS" moodCode="EVN"> | ||
+ | <code code="xxxx" | ||
+ | codeSystem="a.b.c.dx.y.z" | ||
+ | displayName="Antikörperfärbung Prozent" /> | ||
+ | <value xsi:type="CD" code="3" codeSystem="????"> | ||
+ | <originalText><reference value="#d4"/></originalText> | ||
+ | </value> | ||
+ | </observation> | ||
+ | </entry> | ||
+ | |||
+ | <!-— fünfte Information --> | ||
+ | <entry typeCode="DRIV"> | ||
+ | <observation classCode="OBS" moodCode="EVN"> | ||
+ | <code code="xxxx" | ||
+ | codeSystem="a.b.c.dx.y.z" | ||
+ | displayName="Verteilung" /> | ||
+ | <value xsi:type="CD" code="3" codeSystem="????"> | ||
+ | <originalText><reference value="#d5"/></originalText> | ||
+ | </value> | ||
+ | </observation> | ||
+ | </entry> | ||
+ | |||
+ | <!-— sechste Information --> | ||
+ | <entry typeCode="DRIV"> | ||
+ | <observation classCode="OBS" moodCode="EVN"> | ||
+ | <code code="xxxx" | ||
+ | codeSystem="a.b.c.dx.y.z" | ||
+ | displayName="Fixierung" /> | ||
+ | <value xsi:type="CD" code="3" codeSystem="????"> | ||
+ | <originalText><reference value="#d6"/></originalText> | ||
+ | </value> | ||
+ | </observation> | ||
+ | </entry> | ||
+ | |||
+ | <!-— siebte Information --> | ||
+ | <entry typeCode="DRIV"> | ||
+ | <observation classCode="OBS" moodCode="EVN"> | ||
+ | <code code="xxxx" | ||
+ | codeSystem="a.b.c.dx.y.z" | ||
+ | displayName="Gewebe" /> | ||
+ | <value xsi:type="CD" code="3" codeSystem="????"> | ||
+ | <originalText><reference value="#d7"/></originalText> | ||
+ | </value> | ||
+ | </observation> | ||
+ | </entry> | ||
+ | |||
+ | ... | ||
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+ | </section> | ||
+ | </syntaxhighlight > | ||
+ | |||
+ | =====Digitale Bilder===== | ||
+ | Makroskopische sowie mikroskopische Bilder und Virtual Slides müssen eingebunden werden können. Lösungen über DICOM Supplement 122: Specimen Module and Revised Pathology SOP Classes | ||
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[[Kategorie:cdapath|Anhänge]] | [[Kategorie:cdapath|Anhänge]] |
Version vom 20. März 2013, 14:08 Uhr
Dieses Material ist Teil des Leitfadens Pathologiebefund.
|
Inhaltsverzeichnis
Anhang A: Diverses
Offene Punkte
- Codesysteme vervollständigen
- fehlende Abschnitte:
- n.n.
- Elemente und Attribute vollständig auflisten (inkl. Wikifizierung)
- Abgleich mit IHE Anatomic Pathology APSR und HL7 Anatomic Pathology
- ..
Referenzen/Literatur
DIMDI, Alpha_Id: | Alpha-ID - Die Identifikationsnummer, http://www.dimdi.de/static/de/ehealth/alpha-id/index.htm |
DIMDI, Verschl: | Anleitung zur Verschlüsselung, http://www.dimdi.de/static/de/klassi/diagnosen/icd10/icdsgbv20.htm |
DIMDI, Basis: | Basiswissen Codieren, DIMDI 2004 |
BMGS, 2004: | ICD-10-Bekanntmachung des BMGS, http://www.zi-berlin.de/Zi_ICD10Browser/zi_icd_10_browser.htm |
InEK, Codierrichtlinien: | Deutsche Codierrichtlinien – Version 2005, Institut für Entgeltsystem im Krankenhaus (InEK gGmbH) 2004, http://www.g-drg.de/service/download/veroeff_2005/DKR2005_Endversion_PDF30_040916_1500.pdf |
HL7 Datentypen: | HL7 Version 3 Datentypen und CMETs für das Deutsche Gesundheitswesen, www.hl7.de (Publikationen) |
CDAr2Arztbrief: | Arztbrief auf Basis der HL7 Clinical Document Architecture Release 2 für das deutsche Gesundheitswesen, Version 1.50 vom 12.05.2006, herausgegeben vom VHitG, HL7 Deutschland und der Arbeitsgemeinschaft Sciphox, www.hl7.de (Publikationen)
http://www.hl7.de/download/documents/cdar2-arztbrief/Leitfaden-VHitG-Arztbrief-v150.pdf |
Wiley: | TNM-System: Wiley Interscience |
Zeitangaben
In einem Bericht tauchen mehrere Zeitangaben auf, die hier einmal in Form einer Übersicht dargestellt werden sollen. Die Angaben in der Bedingung beziehen sich auf die Nummern aus der ersten Spalte, d.h. hierüber wird eine Reihenfolge etabliert:
# | Datum | Art | Bedingung (bezogen auf #) |
im Krankenhaus | im Labor | HL7 V3 (CDA später) |
---|---|---|---|---|---|---|
1 | Auftragserfassung | Beginn | x | Order | ||
2 | Auftragserfassung | Ende | 1 < 2 | x | ||
3 | Auftragsfreigabe | TS | 2 < 3 | x | ||
4 | Auftragsübermittlung | TS | 3 < 4 | x | ||
5 | Probenentnahme | von/bis | x | Specimen Specimen Collection Process | ||
6 | Probenversand (Ausgang) | TS | 5 < 6 | x | ||
7 | Auftragseingang | TS | 4 < 7 | x | Acknowledgement | |
8 | Auftragsbestätigung | TS | 7 < 8 | x | Promise | |
9 | Probeneingang | TS | 6 < 9 | x | Specimen-> Specimen Process Step | |
10 | Probenuntersuchung | Beginn | 9 < 10 7 < 10 |
x | documentationOf ServiceEvent->
Specimen | |
11 | Probenuntersuchung | Ende | 10 < 11 | x | ||
12 | Befundung | Beginn | 10 < 12 | x | Specimen-> ObservationEvent
author.time | |
13 | Befundung | Ende | 12 < 13 | x | ||
14 | Niederschrift Befund | Beginn | 13 < 14 | x | dataEnterer.time | |
15 | Niederschrift Befund | Ende | 14 < 15 | x | ||
16 | Freigabe Befund | TS | 15 < 16 | x | legalAuthenticator .time | |
17 | Übermittlung Befund | TS | 16 < 17 | x | Wrapper | |
18 | Befundeingang | TS | 17 < 18 | x | Wrapper | |
19 | Befund gelesen | TS | 18 < 19 | x | - |
Freigaben können mehrstufig erfolgen.
Mehrere Berichte in Abhängigkeit des Prozessschrittes
Attribut-Wert-Paare
Die Attribut-Wert-Paare werden textuell aus den codierten Informationen abgeleitet (derived).
Hierzu gehören auch die Cancer Checklists.
Die zu verwendenden Vokabularien sind im Anhang detailliert aufgelistet.
Die Informationen werden als Attribut-Wert-Paare in Form einer Tabelle dargestellt, die wie folgt aussieht.
Entnahme | Resektat |
---|---|
Kalk histologisch | Ja |
Kalk (mm) | 0,2 |
Oder in XML:
<section>
<!-- Darstellung als Tabelle -->
<text>
<tbody>
<tr>
<td><content ID="d1">Entnahme</content></td>
<td>Resektat</td>
</tr>
<tr>
<td><content ID="d2">Kalk Histologisch</content></td>
<td>Ja</td>
</tr>
<tr>
<td><content ID="d3">Kalk (mm)</content></td>
<td>0,2</td>
</tr>
...
</tbody>
</text>
<!-— erste Information -->
<entry typeCode="DRIV">
<observation classCode="OBS" moodCode="EVN">
<code code"Mamma.Entnahme" codeSystem="??????" />
<value xsi:type="CD" code="Resektat" codeSystem="????">
<originalText><reference value="#d1"/></originalText>
</value>
</observation>
</entry>
<!-— zweite Information -->
<entry typeCode="DRIV">
<observation>
<code code="Mamma.Kalk Histologisch" codeSystem="??????" />
<value xsi:type="BL" code="true">
<originalText><reference value="#d2"/></originalText>
</value>
</observation>
</entry>
<!-— dritte Information -->
<entry typeCode="DRIV">
<observation classCode="OBS" moodCode="EVN">
<code code="Mamma.Kalk"
codeSystem="a.b.c.dx.y.z"
displayName="Kalk" />
<value xsi:type="PQ" value="0,2" unit="mm" >
<originalText><reference value="#d3"/></originalText>
</value>
</observation>
</entry>
<!—weitere Information -->
...
</section>
Anlagen
Immunhistochemische Färbungen
Die Informationen zu immunhistochemischen Färbungen bestehen aus folgenden Informationen:
Bedeutung | Datentyp | OID |
---|---|---|
Antikörper (Kurzbezeichnung) | Code oder String?? | 2.16.840.1.113883.6.1 |
Klon | String | 1.2.276.0.76.5.???? |
Hersteller | Code oder String?? | 1.2.276.0.76.5.???? |
Antikörperklasse | CD | ???? |
Protokoll-ID | II | 1.2.276.0.76.5.???? |
Färbeintensität | CD | 1.2.276.0.76.5.???? |
Färbemuster | CD | 1.2.276.0.76.5.???? |
Verteilungsmuster | CD | 1.2.276.0.76.5.???? |
Anteil positiver Zellen | PQ | ?? |
Gewebetyp | CD | 1.2.276.0.76.5.???? |
Färbeergebnis | CD | 1.2.276.0.76.5.???? |
Fixierung | CD | 1.2.840.10008.???? |
Bildanalyseprogramm | String | 1.2.276.0.76.5.???? |
Score-Typ | vgl. Scores & Assessment DSTU | |
Score-Ergebnis | vgl. Scores & Assessment DSTU |
Tabelle 4: Färbungen
Text-Beispiel
Nachfolgend ein Beispiel in der Text-Darstellung:
Anti- körper | Klon | Her- steller | AK- Klasse | Proto- koll- ID | Reak- tions-stärke | Färbe- muster | Vertei- lungs- muster | %pos. Zellen | Gewebe- typ | Färbe- er- gebnis | Fixie- rung | Bild- analyse | Score- Typ | Score-Ergebnis |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ki67 | 30-9 | Ventana | 2 | xyz | stark | nukleär | diffus | 9 | Tumor | positiv | FFPE | Immuno- Ratio | ||
Ki67 | 30-9 | Ventana | 2 | xyz | keine | keine | keine | 0 | neg.Färbe- kontrolle | negativ | FFPE | |||
CK5/6 | D5/16B4 | DAKO | 1 | uvw | mittel | membran- st. komplett | basal | Tumor | positiv | FFPE | ||||
ER/PR pharmDX | 1D5 / ER 2-123 | DAKO | 3 | abc | stark | nukleär | diffus | 87 | Tumor | positiv | FFPE | Immuno- Ratio | Rem- mele | endokrin responsiv |
ER/PR pharmDX | 1D5 / ER 2-123 | DAKO | 3 | abc | stark | nukleär | diffus | 95 | ext. Positiv on-slide-kontrolle |
positiv | FFPE | Immuno- Ratio | ||
ER/PR pharmDX | 1D5 / ER 2-123 | DAKO | 3 | abc | mittel | nukleär | fokal | 30 | int. Positiv kontrolle |
positiv | FFPE | Immuno- Ratio | ||
ER/PR pharmDX | 1D5 / ER 2-123 | DAKO | 3 | abc | keine | keine | keine | 0 | neg.Färbe kontrolle |
negativ | FFPE | |||
ER/PR pharmDX | PgR 1294 | DAKO | 3 | def | mittel | nukleär | diffus | 38 | Tumor | positiv | FFPE | Immuno- Ratio | Rem- mele | endokrin responsiv |
ER/PR pharmDX | PgR 1294 | DAKO | 3 | def | keine | keine | keine | 0 | neg.Färbe kontrolle |
negativ | FFPE |
Abbildung in CDA
Kommentar: muss noch an Textbeispiel angepasst werden.
<section>
<!-- Darstellung als Tabelle -->
<text>
<tbody>
<tr>
<th>Antikörper</th>
<th>Klon</th>
<th>Hersteller</th>
<th>AK-Klasse</th>
<th>Protokoll-ID</th>
<th>Reaktionsstärke</th>
<th>Färbemuster</th>
<th>Verteilungsmuster</th>
<th>% pos. Zellen</th>
<th>Gewebetyp</th>
<th>Färbeergebnis</th>
<th>Fixierung</th>
</tr>
<tr>
<td><content ID="d1">IF Ep MNF116</content></td>
<td><content ID="d2">positiv</content></td>
<td><content ID="d3">stark</content></td>
<td><content ID="d4"> </content></td>
<td><content ID="d5">diffus</content></td>
<td><content ID="d6">Formalin</content></td>
<td><content ID="d7">Tumor isolierte Tumorzelle</content></td>
</tr>
...
</tbody>
</text>
<!-— erste Information -->
<entry typeCode="DRIV">
<observation classCode="OBS" moodCode="EVN">
<code code="????"
codeSystem="??????"
displayName="Antikörperfärbung Art (kurz)" />
<value xsi:type="CD" code="?????" codeSystem="????">
<originalText><reference value="#d1"/></originalText>
</value>
</observation>
</entry>
<!-— zweite Information -->
<entry typeCode="DRIV">
<observation>
<code code="????"
codeSystem="??????"
displayName="Antikörperfärbung Reaktion" />
<value xsi:type="CD" code="2" codeSystem="????">
<originalText><reference value="#d2"/></originalText>
</value>
</observation>
</entry>
<!-— dritte Information -->
<entry typeCode="DRIV">
<observation classCode="OBS" moodCode="EVN">
<code code="xxxx"
codeSystem="a.b.c.dx.y.z"
displayName="Antikörperfärbung Reaktionsstärke" />
<value xsi:type="CD" code="3" codeSystem="????">
<originalText><reference value="#d3"/></originalText>
</value>
</observation>
</entry>
<!-— vierte Information -->
<entry typeCode="DRIV">
<observation classCode="OBS" moodCode="EVN">
<code code="xxxx"
codeSystem="a.b.c.dx.y.z"
displayName="Antikörperfärbung Prozent" />
<value xsi:type="CD" code="3" codeSystem="????">
<originalText><reference value="#d4"/></originalText>
</value>
</observation>
</entry>
<!-— fünfte Information -->
<entry typeCode="DRIV">
<observation classCode="OBS" moodCode="EVN">
<code code="xxxx"
codeSystem="a.b.c.dx.y.z"
displayName="Verteilung" />
<value xsi:type="CD" code="3" codeSystem="????">
<originalText><reference value="#d5"/></originalText>
</value>
</observation>
</entry>
<!-— sechste Information -->
<entry typeCode="DRIV">
<observation classCode="OBS" moodCode="EVN">
<code code="xxxx"
codeSystem="a.b.c.dx.y.z"
displayName="Fixierung" />
<value xsi:type="CD" code="3" codeSystem="????">
<originalText><reference value="#d6"/></originalText>
</value>
</observation>
</entry>
<!-— siebte Information -->
<entry typeCode="DRIV">
<observation classCode="OBS" moodCode="EVN">
<code code="xxxx"
codeSystem="a.b.c.dx.y.z"
displayName="Gewebe" />
<value xsi:type="CD" code="3" codeSystem="????">
<originalText><reference value="#d7"/></originalText>
</value>
</observation>
</entry>
...
</section>
Digitale Bilder
Makroskopische sowie mikroskopische Bilder und Virtual Slides müssen eingebunden werden können. Lösungen über DICOM Supplement 122: Specimen Module and Revised Pathology SOP Classes