cdapath:Materialaufbereitung-Section (Template) - Versionsgeschichte

Gharoske am 5. Juni 2015 um 11:24 Uhr

2015-06-05T11:24:14Z

Gharoske: /* Section: Material und Materialaufbereitung (Procedure Steps) */

2014-12-27T15:26:57Z

‎Section: Material und Materialaufbereitung (Procedure Steps)

Gharoske: /* Organisation nach IHE */

2014-12-27T15:05:43Z

‎Organisation nach IHE

Gharoske: /* Definition und Zweck */

2014-12-27T14:57:23Z

‎Definition und Zweck

Gharoske: /* Organisation nach HL7-D */

2014-09-24T07:46:53Z

‎Organisation nach HL7-D

Gharoske: /* Organisation nach HL7-D */

2014-09-22T14:36:42Z

‎Organisation nach HL7-D

Gharoske: /* Organisation nach IHE */

2014-09-22T14:19:00Z

‎Organisation nach IHE

Gharoske: /* Section: Materialaufbereitung */

2014-08-06T13:43:26Z

‎Section: Materialaufbereitung

Änderungen zeigen

Gharoske: /* Beispiel: */

2014-02-17T15:08:42Z

‎Beispiel:

Gharoske: /* Beispiel: */

2014-02-17T13:11:28Z

‎Beispiel:

@@ Zeile 8: / Zeile 8: @@
 |bgcolor="ddddff"|Template-Typ|| Section
 |-
-|bgcolor="ddddff"|Template ID|| 1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.2.99
+|bgcolor="ddddff"|Template ID|| 1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.2.6
 |-
 |bgcolor="ddddff"|generischeres Template ||

@@ Zeile 56: / Zeile 56: @@
-====Organisation nach IHE====
+====Organisation nach IHE APSR====
 Textinformationen zum Material können sich in den Sections "Klinische Information", "Materialaufbereitung"und evtl. "Makroskopische Beschreibung" finden.
@@ Zeile 71: / Zeile 71: @@
 Alternativ könnte auf das entryRelationship-Konstrukt verzichtet werden, indem für jedes Specimen neben seiner eineindeutigen ID noch die ID seines Ausgangsproduktes (parentID) angegeben wird (gemäß V3_DAM_SPECIMEN_R1_I1_2014MAY).
-====Organisation nach HL7-D====
+Für die Organisationsfunktion des Materials bieten sich die drei "klassischen" Materialebenen an: Part (Teil), Block, Schnitt, von denen bisher nur der Part als Organisationseinheit für konventionelle Befunde genutzt wird. Eine exakte Unterscheidung zwischen Specimen und Container erfolgt bisher nicht, ist aber für Spezialfälle (Tissue Micro Arrays - TMA, on-slide-Kontrollen, Serienschnitte) unabdingbar.
 Alle Beziehungen zwischen Beobachtung und Specimen werden durch Referenzierung auf die Specimen-ID hergestellt.
 Die auf der "Part"-Ebene von ELGA (ELGA_CDA_Laborbefund_2.00_FWGD) vorgeschlagene Strukturierung der Spezimeninformation für Laborbefunde ist [[nicht]] zum IHE-Konstrukt der Procedure Steps Section [[kompatibel]]:
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 ===Attribute===
 Diese Section muss ein Code Element enthalten, das mit folgenden Attributen gefüllt ist:
@@ Zeile 351: / Zeile 351: @@
 <section>
    <templateId root='1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.2.99'/>
-   <code code='68992-7' displayName='Specimen-related information panel'
+   <code code='46059-2' displayName='Special treatments and procedures section'
          codeSystem='2.16.840.1.113883.6.1' codeSystemName='LOINC'/>
    <title>PROCEDURE STEPS</title>
@@ Zeile 359: / Zeile 359: @@
        Probe 2 (bezeichnet als “ax.Fettgewebe apikal”), in zwei Teilen übersandt, wird vollständig gebettet und mit zahlreichen Schnittstufen untersucht.
    </text>
-   <!-- Specimen Information Organizer -->
+   <!-- Procedure steps entry -->
-   <entry>
+   <entry typeCode="" contextConductionInd="false">
-     <organizer classCode="CLUSTER" moodCode="EVN">
+    <procedure negationInd="false" classCode="PROC" moodCode="EVN">
-       <templateId root="1.3.6.1.4.1.19376.1.8.1.4.4"/>
+        <templateId root="2.16.840.1.113883.10.12.306"/>
-        <!-- followed by Specimen collection procedure and Problem organizer -->
+        <templateId root="2.16.840.1.113883.3.1937.99.61.5.10.900283"/>
-     </organizer>
+          <id root="1.2.3.999" extension="--example only--"/>
    </entry>
 </section>

@@ Zeile 60: / Zeile 60: @@
 Textinformationen zum Material können sich in den Sections "Klinische Information", "Materialaufbereitung"und evtl. "Makroskopische Beschreibung" finden.
-Die Steuerungsfunktion wird durch die Materialaufbereitungs Section (Procedure Steps section) gewährleistet. In dieser Section werden unter dem  "Specimen procedure step entry", ein Child Element Content Module, die hierarchischen Beziehungen zwischen den Specimen auf Case- Part- Block- und Slide-Ebene gemäß CDA-RIM über entryRelationships abgebildet, indem die Specimens einer Hierarchie-Ebene jeweils als produkt der prozedur der übergeordneten Hierarchie-Ebene beschrieben werden.
+Die Steuerungsfunktion wird durch die Materialaufbereitungs Section (Procedure Steps section) gewährleistet. In dieser Section werden unter dem  "Specimen procedure step entry", ein Child Element Content Module, die hierarchischen Beziehungen zwischen den Specimen auf Case- Part- Block- und Slide-Ebene gemäß CDA-RIM über entryRelationships abgebildet, indem die Specimens einer Hierarchie-Ebene jeweils als Produkt der prozedur der übergeordneten Hierarchie-Ebene beschrieben werden.
 Das IHE Diagramm veranschaulicht diese Zusammenhänge.
@@ Zeile 67: / Zeile 67: @@
 Abb.: Entries der Specimen Procedure Step Section
 ====Organisation nach HL7-D====

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 ===Definition und Zweck===
-Diese Section beschreibt die Proben (Material, Specimens), die übersandt wurden und die Materialaufbereitung: Repräsentative Proben und davon abgeleitete Gewebsproben für weitere Untersuchungstechniken (Flowzytometrie, zytogenetische und molekularpathologische Untersuchungen, Elektronenmikroskopie etc.) oder Biobanken. Diese Informationen werden in einem Specimen Information Organizer Entry organisiert. Alternativ werden alle Specimen collectioon procedure Informationen sowie alle diagnostischen Probleme, die während der Untersuchung der Specimens oder Gruppen von Specimens relevant geworden sind, in einem Specimen Collection Procedure Entry Modul und in einem Problem organizer Entry Modul aufgelistet.
+Diese Section beschreibt die Proben (Material, Specimens), die übersandt wurden, die Methode ihrer Gewinnung und ihre Herkunft (Specimen collection) und die Materialaufbereitung (Specimen processing): Repräsentative Proben, Schritte des Workflow (Trimming, Embedding, Cutting, Staining) und davon abgeleitete Gewebsproben für weitere Untersuchungstechniken (Flowzytometrie, zytogenetische und molekularpathologische Untersuchungen, Elektronenmikroskopie etc.) oder Biobanken. Diese Informationen werden in einem Specimen Information Organizer Entry organisiert (IHE APSR evolution 2014). Alternativ werden alle Informationen der Specimen collection procedure und Specimen processing procedures in einem Specimen Collection Procedure Entry Modul sowie alle diagnostischen Probleme, die während der Untersuchung der Specimens oder Gruppen von Specimens relevant geworden sind,in einem Problem organizer Entry Modul aufgelistet.
 ===Erläuterungen===

@@ Zeile 73: / Zeile 73: @@
   GH:an IHE anpassen. 2014_09_22
 }}
-Die Informationen zum Material werden in der Materialaufbereitungs-Section gesammelt und nicht über den gesamten Befund verstreut. In dieser Section werden auch die zu beschreibenden Probleme aufgeführt und identifiziert. Specimen- und Problembeschreibung könnten durch einen Specimen Information Organizer gebündelt werden
+Die Informationen zum Material einschließlich seiner Weiterverarbeitung bis zum gefärbten histologischen Schnitt werden in der Materialaufbereitungs-Section gesammelt und nicht über den gesamten Befund verstreut.
-Alle Beziehungen zwischen Beobachtung und Material bzw. Problem werden durch Referenzierung auf die Material-und Problem-ID hergestellt.
+Alle Beziehungen zwischen Beobachtung und Specimen werden durch Referenzierung auf die Specimen-ID hergestellt.
-Für die Organisationsfunktion des Materials böten sich auch die drei "klassischen" Materialebenen an: Part (Teil), Block, Schnitt, von denen bisher nur der Part als Organisationseinheit für die Befunde genutzt wird. Eine exakte Unterscheidung zwischen Part und Container erfolgt bisher nicht.
+Für die Organisationsfunktion des Materials bieten sich die drei "klassischen" Materialebenen an: Part (Teil), Block, Schnitt, von denen bisher nur der Part als Organisationseinheit für konventionelle Befunde genutzt wird. Eine exakte Unterscheidung zwischen Specimen und Container erfolgt bisher nicht, ist aber für Spezialfälle (Tissue Micro Arrays - TMA, on-slide-Kontrollen, Serienschnitte) unabdingbar.
-Für eine perspektivische Berücksichtigung von Digitalen Bildern (bis zum Virtual Slide) sollte die in IHE-PAT_TF-1   ([http://www.ihe.net/Technical_Framework/upload/IHE_PAT_TF_Rev2-0_Vol1_TI_2010-07-23.pdf]S.40-45) bzw. DICOM Suppl. 122 ([ftp://medical.nema.org/medical/dicom/final/sup122_ft2.pdf], S.17 ff) vorgenommene Analyse der Beziehungen von Specimen und Container unbedingt im Auge behalten und in diesem Leitfaden berücksichtigt werden.
+Für eine perspektivische Berücksichtigung von Digitalen Bildern (bis zum Virtual Slide) sollte die in IHE-PAT_TF-1   ([http://www.ihe.net/Technical_Framework/upload/IHE_PAT_TF_Rev2-0_Vol1_TI_2010-07-23.pdf]S.40-45) bzw. DICOM Suppl. 122 ([ftp://medical.nema.org/medical/dicom/final/sup122_ft2.pdf], S.17 ff) vorgenommene Analyse der Beziehungen von Specimen und Container unbedingt in diesem Leitfaden berücksichtigt werden.
-Die dafür notwendigen gestaffelten ID´s von Container und Specimen (Part, Block, Slide) sowie die Specimen Preparation Sequence und Specimen Preparation Step Content Item Sequence müssen vom Pathologiesystem gemäß DICOM Suppl. 122 bereitgestellt werden.
+Die dafür notwendigen gestaffelten ID´s von Container und Specimen (Part, Block, Slide) sowie die Hierarchie der Specimens und Container einschl. der jeweiligen Herkunft und der Prozeduren, die zum Specimen geführt haben (im DICOM Modell die Specimen Preparation Sequence und Specimen Preparation Step Content Item Sequence) müssen vom Pathologiesystem gemäß DICOM Suppl. 122 bereitgestellt werden.
-Auf der "Part"-Ebene kann die von ELGA (ELGA_CDA_Laborbefund_2.00_FWGD) vorgeschlagene Strukturierung der Spezimeninformation für Laborbefunde wahrscheinlich zum großen Teil durch das IHE-Konstrukt von Specimen Information Organizer mit dem Specimen Collection Procedure Template realisiert werden:
+Die auf der "Part"-Ebene von ELGA (ELGA_CDA_Laborbefund_2.00_FWGD) vorgeschlagene Strukturierung der Spezimeninformation für Laborbefunde ist [[nicht]] zum IHE-Konstrukt der Procedure Steps Section [[kompatibel]]:
 {| class="hl7table"
@@ Zeile 105: / Zeile 105: @@
 |-
 |}
 Der in Abstimmung befindliche ELGA-Vorschlag zu "Entnahmeort" (procedure target site) ist in folgender Tabelle dargestellt, ergänzt durch SNOMED CT Codes. Diese Darstellung reicht jedoch möglicherweise nicht in jedem Fall aus:

@@ Zeile 211: / Zeile 211: @@
 Einsendung (Specimen): Zystoprostatektomiepräparat
-- specimen collection method: -- radical cystoprostatectomy (procedure)<br>
+a) specimen collection method: <br>
-- specimen type: -- specimen from urinary bladder obtained by radical cystectomy (specimen)<br>
+a1) radical cystoprostatectomy (procedure), for all<br><br>
--- specimen from prostate obtained by radical prostatectomy (specimen)<br>
+b) specimen type: <br>
--- Tissue specimen from urethra (specimen)<br>
+b1) specimen from urinary bladder obtained by radical cystectomy (specimen)<br>
--- specimen obtained by marginal resection (specimen)<br>
+b2) specimen from prostate obtained by radical prostatectomy (specimen)<br>
-- specimen collection source site: -- prostate and urinary bladder combinated site (body structure) <br>
+b3) Tissue specimen from urethra (specimen)<br>
--- Urethra part (body structure)
+b4) specimen obtained by marginal resection (specimen)<br><br>
-- specimen treatmentProcedure: -- Tissue processing technique, routine, embed, cut and stain, per surgical specimen (procedure)<br>
+c) specimen collection source site: <br>
--- Tissue frozen section technique, complete (procedure)<br>
+c1) prostate and urinary bladder combinated site (body structure), for b1), b2) <br>
 Vom Pathologiesystem werden für jedes dieser Items separate IDs vergeben, die diese Hierarchie wiedergeben können, aber nicht müssen. Im APSR finden diese IDs Verwendung bei der Referenzierung der AP observations. Jede ID muss eineindeutig die Charakteristika des jeweiligen Specimens rückverfolgbar machen.